Studiare nuovi gruppi di microbi del suolo

I microbi del terreno come i batteri e i funghi scompongono la materia vegetale (cellulosa) ricca di carbonio. Per questo motivo hanno un ruolo fondamentale nel ciclo del carbonio sulla Terra, ciononostante non si conoscono ancora bene i fattori che influenzano la diversità e l'attività dei microbi del terreno.

In passato solo la piccolissima percentuale dei microorganismi del terreno che è possibile coltivare in laboratorio è stata studiata per capire meglio la degradazione della cellulosa. Adesso però, grazie a tecniche molecolari moderne, si possono studiare direttamente campioni di terreno.

Alcune di queste tecniche sono state ampliate recentemente nell'ambito del progetto (SAE_SNSP_UVA) (“Nanosims enabled approach to understand bacterial and fungal cellulose degraders in soils”). In particolare, i ricercatori sono stati in grado di estrarre componenti dei campioni abbastanza piccoli da permettere il sequenziamento del genoma di una singola cellula usando strumenti avanzati.

Come prova di concetto del loro nuovo metodo di estrazione, lo hanno applicato per la rilevazione di microbi coinvolti nella degradazione della cellulosa del suolo di un bosco di faggi. Più in particolare, hanno usato studi biochimici, molecolari ed enzimatici per caratterizzare diversi gruppi di questi microorganismi.

Una delle principali scoperte è stata che l'aggiunta di glucosio ai campioni provocava un cambiamento all'interno della comunità che favoriva i batteri, mentre l'aggiunta di azoto inorganico favoriva i funghi.

Lo studio ha approfondito le nostre conoscenze sulla degradazione della cellulosa e sui fattori che la regolano. Poiché il terreno contiene il più grande deposito di carbonio sulla Terra, è importante capire meglio il suo ruolo nel ciclo terrestre del carbonio.