Migliorare i modelli delle reti biologiche
Un recente progetto ha sviluppato modelli matematici per la ricostruzione delle reti biologiche come quelle utilizzate per comprendere meglio l'evoluzione e la biologia cellulare.
I modelli matematici delle reti svolgono un ruolo sempre più importante
nella ricerca biologica. Le dinamiche delle reti complesse definiscono
molti sistemi biologici, come gli ecosistemi, la coevoluzione delle
specie e le reti molecolari delle piante e degli animali.
Il progetto BIONETRECON ("Reconstruction algorithms for biological
networks"), finanziato dall'UE, ha cercato di creare e testare algoritmi
che aiutino gli scienziati a ricostruire queste reti biologiche. In
particolare, questa attività sarà utile per la ricostruzione degli
alberi evolutivi, o filogenesi, e delle correlazioni tra popolazioni di
singole specie (pedigree).
Prima di tutto, il team ha cercato di migliorare la ricostruzione
degli alberi filogenetici, riuscendo a definire in modo più accurato i
presupposti necessari per renderli più accurati.
Le altre attività svolte dal team BIONETRECON hanno dimostrato che
due ipotesi preliminari ormai consolidate da lungo tempo in materia di
filogenetica sono in realtà contraddittorie e hanno registrato progressi
nel miglioramento dell'accuratezza del modello Catena di Markov Monte
Carlo, un metodo impiegato diffusamente per la ricostruzione
filogenetica.
BIONETRECON ha fornito un contributo molto significativo,
migliorando la conoscenza e la precisione della ricostruzione delle reti
biologiche.
pubblicato: 2015-01-29